某研究所的员工构成情况是：所有的工程师都是男性，并非所有工程师都是研究生，并非所有研究生都是男性。由此可以推出：

第一步：分析题干
题干推理规则为：
①工程师→男性
②有的工程师→非研究生
③有的研究生→非男性

第二步：分析选项
A选项：有的男性→非工程师。“有些A是B”推不出“有些B不是A”，所以A错。

B选项：有的男研究生→工程师。“男研究生”在题干中未提及，不能推出，所以B错。

C选项：有的研究生→男性。由③：有的研究生→非男性，当“有的不”为真时“有的是”真假不定，即不能推出有的研究生是男性，所以C错。

D选项：有的男性→非研究生。由②“有的工程师→非研究生”可以推出“有的非研究生→工程师”（“有些A是B”等价于“有些B是A”），再由①“工程师→男性”可推出“有的非研究生→男性”即“有的男性不是研究生”，所以选D。

故本题选D。
【2017-河南-074】